MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 58334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017038	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320911
2	NC_017038	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320911
3	NC_017038	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320911
4	NC_017038	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	383320911
5	NC_017038	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320911
6	NC_017038	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320911
7	NC_017038	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383320911
8	NC_017038	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320911
9	NC_017038	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320911
10	NC_017038	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	383320911
11	NC_017038	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320912
12	NC_017038	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320912
13	NC_017038	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	383320912
14	NC_017038	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
15	NC_017038	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	383320912
16	NC_017038	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320912
17	NC_017038	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320912
18	NC_017038	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
19	NC_017038	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320912
20	NC_017038	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320912
21	NC_017038	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	383320912
22	NC_017038	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	383320913
23	NC_017038	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320913
24	NC_017038	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383320913
25	NC_017038	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320913
26	NC_017038	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320913
27	NC_017038	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320913
28	NC_017038	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	383320913
29	NC_017038	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320913
30	NC_017038	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320913
31	NC_017038	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320914
32	NC_017038	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	383320914
33	NC_017038	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320914
34	NC_017038	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320914
35	NC_017038	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320914
36	NC_017038	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320914
37	NC_017038	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320914
38	NC_017038	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	383320914
39	NC_017038	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320914
40	NC_017038	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320914
41	NC_017038	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320914
42	NC_017038	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320914
43	NC_017038	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320914
44	NC_017038	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320915
45	NC_017038	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320915
46	NC_017038	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
47	NC_017038	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320915
48	NC_017038	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
49	NC_017038	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
50	NC_017038	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320915
51	NC_017038	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
52	NC_017038	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320915
53	NC_017038	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	383320915
54	NC_017038	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	383320915
55	NC_017038	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320915
56	NC_017038	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320915
57	NC_017038	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	383320915
58	NC_017038	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	383320915
59	NC_017038	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320915
60	NC_017038	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	383320915
61	NC_017038	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320916
62	NC_017038	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320916
63	NC_017038	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320916
64	NC_017038	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320916
65	NC_017038	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320916
66	NC_017038	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	383320916
67	NC_017038	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320916
68	NC_017038	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320916
69	NC_017038	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320916
70	NC_017038	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320916
71	NC_017038	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320916
72	NC_017038	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320916
73	NC_017038	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320916
74	NC_017038	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320916
75	NC_017038	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320916
76	NC_017038	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
77	NC_017038	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	383320917
78	NC_017038	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320917
79	NC_017038	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320917
80	NC_017038	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
81	NC_017038	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
82	NC_017038	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	383320917
83	NC_017038	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
84	NC_017038	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
85	NC_017038	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320917
86	NC_017038	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
87	NC_017038	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320917
88	NC_017038	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320917
89	NC_017038	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320917
90	NC_017038	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	383320917
91	NC_017038	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
92	NC_017038	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320917
93	NC_017038	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320917
94	NC_017038	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320917
95	NC_017038	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320917
96	NC_017038	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
97	NC_017038	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320917
98	NC_017038	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
99	NC_017038	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320917
100	NC_017038	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383320917
101	NC_017038	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320917
102	NC_017038	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383320917
103	NC_017038	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320918
104	NC_017038	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320918
105	NC_017038	A	8	8	8543	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	383320918
106	NC_017038	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383320918
107	NC_017038	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320918
108	NC_017038	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	383320918
109	NC_017038	TC	3	6	8646	8651	0 %	50 %	0 %	50 %	383320918
110	NC_017038	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320918
111	NC_017038	TGG	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320918
112	NC_017038	AAAG	2	8	8709	8716	75 %	0 %	25 %	0 %	383320918
113	NC_017038	GTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320918
114	NC_017038	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320918
115	NC_017038	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320918
116	NC_017038	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320918
117	NC_017038	CAT	4	12	9076	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320918
118	NC_017038	AAC	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320918
119	NC_017038	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320918
120	NC_017038	TC	3	6	9123	9128	0 %	50 %	0 %	50 %	383320918
121	NC_017038	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320918
122	NC_017038	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383320918
123	NC_017038	AGCC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	383320918
124	NC_017038	G	6	6	9430	9435	0 %	0 %	100 %	0 %	383320918
125	NC_017038	ACA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383320918
126	NC_017038	GGC	2	6	9523	9528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320918
127	NC_017038	GGGC	2	8	9587	9594	0 %	0 %	75 %	25 %	383320918
128	NC_017038	GCA	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320918
129	NC_017038	C	6	6	9668	9673	0 %	0 %	0 %	100 %	383320918
130	NC_017038	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	383320918
131	NC_017038	ATG	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320918
132	NC_017038	TAG	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320918
133	NC_017038	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320918
134	NC_017038	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383320918
135	NC_017038	TTA	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383320918
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259	NC_017038	ATTT	2	8	17346	17353	25 %	75 %	0 %	0 %	383320924
260	NC_017038	GCAG	2	8	17381	17388	25 %	0 %	50 %	25 %	383320924
261	NC_017038	GCA	2	6	17524	17529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383320924
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263	NC_017038	GTT	2	6	17574	17579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383320924
264	NC_017038	GCC	2	6	17640	17645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320924
265	NC_017038	CTA	2	6	17652	17657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383320924
266	NC_017038	GAT	2	6	17658	17663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320924
267	NC_017038	GCG	2	6	17896	17901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383320925
268	NC_017038	ACC	2	6	17935	17940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383320925
269	NC_017038	AGT	2	6	17945	17950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383320925
270	NC_017038	GGT	2	6	18126	18131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383320925
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283	NC_017038	T	7	7	18892	18898	0 %	100 %	0 %	0 %	383320925
284	NC_017038	G	6	6	18908	18913	0 %	0 %	100 %	0 %	383320925
285	NC_017038	GCC	2	6	18930	18935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383320925
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